Elma ve Erwinia amylovora İnteraksiyonlarında Etkili Proteinler

Özet

Erwinia amylovora‘nın neden olduğu ateş yanıklığı hastalığı, Rosaceae familyasından yaklaşık 140 bitkide enfeksiyon yapabilmekte ve tüm dünyada yumuşak çekirdekli meyve yetiştiriciliği açısından büyük bir tehdit oluşturmaktadır. E. amylovora, konukçularında hastalığa neden olabilmesi için amylovoran ve Tip III salgı sistemlerine (T3SS) ihtiyaç duymaktadır. AmsB, AmsD, AmsE, AmsF, AmsG, AmsJ, AmsI ve AmsK proteinleri, bir amylovoran birimi oluşturmak için farklı galaktoz, glukuronik asit ve piruvil alt birimlerinin lipit taşıyıcıya bağlanmasında rol oynarlar. E. amylovora tarafından salgılanan T3SS proteinleri, HrpA HrpN, HrpW, AvrRpt2EA, HopC1 ve DspA/E‘ dir. E. amylovora‘nın tek efektörü olan DspA/E, pilusun oluşumu sırasında T3SS yoluyla salgılanmaktadır. E. amylovora‘nın şaperon proteini ise IA sınıfı içerisinde yer alan DsB/F‘dir. Eop1 (dış membran proteini), E. amylovora salgı proteinlerinden biri olarak karakterize edilmiştir. Harpinlere ek olarak, E. amylovora‘nın Hrp-salgı sistemi yoluyla patojenisite proteini DspE ve OrfB proteinleri salgılanmaktadır. E. amylovora, bir Hrp pilusu oluşturmaktadır ve bu da yapısal bir protein olan HrpA, tarafından meydana gelmektedir. Patojene karşı direnç kazandırmak amacıyla elma ve armutta klonlanan ve eksprese edilen antimikrobiyal proteinleri kodlayan genler; attacin E, cecropins ve lizozimlerdir. Elmada, E. amylovora enfeksiyonu ile PR2, PR5 ve PR8 proteinlerinin ifadesi artmaktadır. Yine elmalardaki HIPM proteini, E. amylovora HrpN proteini ile etkileşim göstermekte olup HIPM proteini çiçeklerde, yapraklarda ve sürgünlerde olduğundan daha fazla miktarda bulunmaktadır. Ayrıca E. amylovora efektör proteini DspA/E ile etkileşime giren dört elma proteini (DIPMs) dayanıklılıkta etkili role sahiptirler. Bitki ve patojen arasındaki etkileşimin anlaşılabilmesi için konukçuda patojeni tanıyan proteinlerin yanı sıra enfeksiyon sonucu oluşan sinyal sistemi ve bitki savunma mekanizmasının da anlaşılması ile mümkün olacaktır. Bu çalışmada E. amylovora‘nın elmalarda enfeksiyonu sonucu patogenezle ilişkili proteinlerin rolleri ortaya konulmaya çalışılmıştır.