Yerli Sığır Irklarında TLR2 -EcoRV, NOD2- BsaHI ve IFNγ- HphI Allelerinin Frekans Dağılımının İncelenmesi

Özet

Değişen iklim koşulları ve artan nüfus olası risklere karşı önlem alınması ihtiyacına yol açmıştır. Hayvansal üretimi de içine alan tarımsal alanda çalışan araştırıcılar hastalıklara ve çevresel strese dayanıklı çeşit ve türler bulma ve bunları geliştirme üzerine yoğunlaşmışlardır. Hastalık ve çevresel strese dayanıklılığı etkileyen gen bölgelerinin tespit edilmesi ile bu özellikler bakımından seleksiyon yapılması sağlanabilecektir. Bu nedenle gerçekleştirilen çalışmada beş yerli sığır ırkında genotipik yapı daha önce paratuberculosis ile ilişkili olduğu bildirilmiş TLR2, NOD2 ve IFNγ genlerine ait SNP‘ler (sırasıyla EcoRV, BsaHI ve HphI enzimleri kullanılarak) bakımından PCR-RFLP yöntemi ile incelenmiştir. Yerli Güney Sarısı (NSY= 29), Güneydoğu Anadolu Kırmızısı (EAR=35), Boz Irk (AG=36), Güneydoğu Anadolu Kırmızısı (SAR=34), Yerli Kara (NB=35) ırklarından toplam 169 hayvan analiz edilmiştir. Allel ve genotip frekansları PopGene32 programı ile hesaplanmış, populasyonların Hardy-Weinberg dengesinde olup olmadıkları Khi-kare testi ile kontrol edilmiştir. TLR2- EcoRV ve NOD2- BsaHI lokuslarında iki allel (sırasıyla C ve A, C ve T) ve üç genotip belirlenirken, IFNγ- HphI lokusu G alleli bakımından monomorfik bulunmuştur. TLR2- EcoRV lokusunda C alleli NB dışında tüm ırklarda, NOD2- BsaHI lokusunda tüm ırklarda C alleli predominanttı. NOD2- BsaHI lokusu bakımından tüm ırklar HW dengesinde bulunmuş ancak TLR2- EcoRV lokusu bakımından NSY ve SAR ırkları HW‘den sapma göstermiştir.