Süt Ürünlerindeki Laktik Asit Bakterilerinin Moleküler Yöntemlerle Dinamiklerinin Analizi ve Populasyonlarının Tanımlanması

Özet

Farklı ekolojik nişlere sahip Laktik asit bakterileri (LAB) yaygın olarak fermente et, sebze, süt ürünleri ve tahıllar yanı sıra mayalanmış içkilerde de bulunmaktadır. LAB‘lar probiyotik özelliklerinden dolayı starter kültür olarak süt endüstrisinde kullanılan bakterilerin en önemli grubudur. LAB‘ların taksonomik incelemelerinde; 16S ribozomal RNA (rRNA) gen dizilerinin analizine dayalı rep-PCR analizi, farklı boyutlarda enzimler ile kesilmiş DNA fragmanlarının analizi (RFLP), rastgele çoğaltılmış polimorfik DNA analizi (RAPD), düşük sıcaklıklarda rastgele çoğaltılmış ve DNA'nın çoğaltılmış parça-uzunluk polimorfizm analizi (AFLP)–PCR kullanılmaktadır. Ayrıca LAB‘ların tanımlanmasında kullanılan kültür bağımsız yöntemler, darbe etkili alan jel elektroforez (PFGE), denatüre gradyan jel elektroforez (DGGE), termal gradyan jel elektroforez (DGGE) ve floresan in situ hibridizasyon (FISH) yöntemleri bulunmaktadır. Bunun yanı sıra, son yıllarda yeni nesil dizi (NGS) teknikleri ve Pirosekanslama gelecekte kullanılan en önemli yöntemlerden biri olacaktır. Bu yazıda süt ürünlerinde LAB türlerinin belirlenmesi için moleküler yöntemleri kullanan çalışmaları kapsamaktadır.